118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1146 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 1504 aa  3034    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1553 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  29.02 
 
 		 1261 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  28.73 
 
 		 1255 aa  210  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  27.3 
 
 		 1258 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  27.67 
 
 		 1248 aa  197  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1532 aa  194  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1541 aa  190  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1543 aa  188  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  27.3 
 
 		 837 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1543 aa  179  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  34 
 
 		 644 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1543 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  28.43 
 
 		 1306 aa  172  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  27.2 
 
 		 1257 aa  171  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1463 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  37.94 
 
 		 1206 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.72 
 
 		 14944 aa  165  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1133 aa  162  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  27.33 
 
 		 1537 aa  145  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  29.08 
 
 		 1168 aa  143  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.81 
 
 		 1072 aa  142  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  49.33 
 
 		 4465 aa  137  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  40.37 
 
 		 1577 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  46.67 
 
 		 978 aa  130  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  26.35 
 
 		 900 aa  126  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  47.54 
 
 		 841 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1252 aa  122  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  26.07 
 
 		 906 aa  119  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1699 aa  115  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1191 aa  115  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  40.44 
 
 		 613 aa  112  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  44.53 
 
 		 1141 aa  111  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  24.67 
 
 		 1382 aa  109  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1508 aa  108  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.58 
 
 		 904 aa  106  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1544 aa  105  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  41.86 
 
 		 918 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  33.78 
 
 		 886 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1576 aa  97.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  25.2 
 
 		 907 aa  94.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  32.16 
 
 		 1172 aa  94.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.85 
 
 		 3802 aa  92.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  38.6 
 
 		 2392 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 831 aa  86.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  36.36 
 
 		 2447 aa  86.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 		 995 aa  84  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  39.53 
 
 		 2252 aa  83.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1085 aa  82.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  34.19 
 
 		 2215 aa  81.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  38 
 
 		 654 aa  78.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  23.94 
 
 		 1008 aa  72.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.1 
 
 		 966 aa  70.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  42.17 
 
 		 569 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  34.09 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  23.06 
 
 		 3907 aa  68.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  33.83 
 
 		 584 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  25.22 
 
 		 875 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 		 1293 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  26.22 
 
 		 778 aa  64.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  27.07 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.96 
 
 		 2334 aa  62.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  28.97 
 
 		 849 aa  61.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  31.3 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  29.93 
 
 		 1310 aa  58.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  33.96 
 
 		 902 aa  58.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.26 
 
 		 1064 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.28 
 
 		 765 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  30.63 
 
 		 423 aa  58.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.95 
 
 		 4433 aa  57.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  28.4 
 
 		 793 aa  57  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  27.71 
 
 		 889 aa  57  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.42 
 
 		 4761 aa  56.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  29.37 
 
 		 913 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  29.17 
 
 		 913 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  28 
 
 		 4357 aa  55.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  25.39 
 
 		 999 aa  55.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0164  protective antigen  25.3 
 
 		 764 aa  55.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 884 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  30.65 
 
 		 1314 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 913 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  25.52 
 
 		 882 aa  53.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  24.54 
 
 		 882 aa  54.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  35.58 
 
 		 1565 aa  53.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  31.21 
 
 		 3273 aa  53.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  31 
 
 		 581 aa  52.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1931 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.5 
 
 		 558 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.8 
 
 		 6678 aa  50.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1374 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  34.19 
 
 		 2066 aa  50.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  30.3 
 
 		 914 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  31.12 
 
 		 364 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  26.88 
 
 		 897 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  27.21 
 
 		 906 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1101 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.67 
 
 		 760 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>