170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3093 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  100 
 
 
569 aa  1171    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.77 
 
 
558 aa  628  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32 
 
 
307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.63 
 
 
312 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.17 
 
 
478 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40.46 
 
 
1206 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  41.22 
 
 
1236 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 
262 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.4 
 
 
760 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.39 
 
 
790 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.88 
 
 
1967 aa  90.5  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  25.24 
 
 
531 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.36 
 
 
766 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.22 
 
 
321 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.62 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.19 
 
 
499 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  25.46 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.47 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  39.58 
 
 
978 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.3 
 
 
687 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  32.68 
 
 
969 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.65 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  23.79 
 
 
428 aa  77  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.69 
 
 
433 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  23.47 
 
 
350 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  32.37 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  30.33 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.2 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  25.97 
 
 
682 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  36.73 
 
 
14944 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  42.17 
 
 
1504 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.71 
 
 
841 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
629 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  28.34 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.66 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  28.77 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.4 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.1 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.29 
 
 
2334 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.7 
 
 
431 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  27.81 
 
 
394 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  25.45 
 
 
424 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.43 
 
 
336 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.64 
 
 
400 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.58 
 
 
437 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  26.74 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.09 
 
 
304 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.01 
 
 
558 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.11 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  24.75 
 
 
291 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  25 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  51.85 
 
 
736 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.36 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.36 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  24.54 
 
 
433 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.33 
 
 
437 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  22.33 
 
 
719 aa  57.4  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 
496 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  23.04 
 
 
422 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.74 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  25.4 
 
 
1141 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.49 
 
 
574 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  30.53 
 
 
613 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.91 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  24.64 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.54 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.54 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  24.2 
 
 
268 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.92 
 
 
430 aa  55.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.54 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  21.54 
 
 
437 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  21.54 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.16 
 
 
456 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.54 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.72 
 
 
918 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.27 
 
 
3802 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0329  sulfatase  22.92 
 
 
370 aa  54.3  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  24.09 
 
 
269 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  24.64 
 
 
268 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.98 
 
 
262 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  29.32 
 
 
999 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 
812 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 
812 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  26.64 
 
 
777 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  23.84 
 
 
268 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  32.5 
 
 
4465 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2123  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.91 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  22.91 
 
 
265 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.24 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.7 
 
 
445 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.9 
 
 
280 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  28.77 
 
 
644 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  23.55 
 
 
268 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 
831 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  27.19 
 
 
522 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06589  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04290)  28.06 
 
 
1067 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0901607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.28 
 
 
964 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  23.04 
 
 
413 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  30 
 
 
2215 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  23.72 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>