87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2628 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 999 aa  2026    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  43.42 
 
 		 421 aa  295  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  32.9 
 
 		 770 aa  195  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  33.87 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  34.63 
 
 		 541 aa  194  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  34.59 
 
 		 772 aa  186  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  33.4 
 
 		 570 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  32.07 
 
 		 454 aa  175  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  30.98 
 
 		 682 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1023 aa  171  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  32.74 
 
 		 473 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  31.76 
 
 		 568 aa  169  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  30.42 
 
 		 701 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  33.04 
 
 		 819 aa  162  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  30.74 
 
 		 565 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  29 
 
 		 498 aa  139  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  28.87 
 
 		 924 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  30.72 
 
 		 593 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  27.45 
 
 		 843 aa  126  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  29.26 
 
 		 421 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  29.65 
 
 		 450 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  29.52 
 
 		 425 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  29.86 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  26.74 
 
 		 537 aa  114  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  28.61 
 
 		 421 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34 
 
 		 1031 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  29.41 
 
 		 431 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.69 
 
 		 1063 aa  107  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  27.73 
 
 		 459 aa  99.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  35.33 
 
 		 480 aa  94.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.74 
 
 		 425 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  26.44 
 
 		 427 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  28.77 
 
 		 701 aa  81.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  25.95 
 
 		 446 aa  80.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.34 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  24.14 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  25.63 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  31.41 
 
 		 1363 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  38.61 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.9 
 
 		 2068 aa  63.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  30.15 
 
 		 1380 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  30.17 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  36.63 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.35 
 
 		 836 aa  61.6  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  29.8 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.96 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.78 
 
 		 779 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.24 
 
 		 1042 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  33.96 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  35.06 
 
 		 2334 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  33.04 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  37.78 
 
 		 861 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1504 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  35.16 
 
 		 995 aa  55.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 3333 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.31 
 
 		 9585 aa  54.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 776 aa  53.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  35.29 
 
 		 841 aa  53.5  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.78 
 
 		 670 aa  53.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  30.23 
 
 		 1131 aa  53.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  33.94 
 
 		 580 aa  52.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  27.82 
 
 		 674 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  24.6 
 
 		 3507 aa  52.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1133 aa  51.6  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 4433 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  27.23 
 
 		 2286 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  34.15 
 
 		 639 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  26.09 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  25.74 
 
 		 1310 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  30.81 
 
 		 1973 aa  49.3  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  48.5  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31.25 
 
 		 2160 aa  48.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  25.68 
 
 		 1735 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  33.57 
 
 		 692 aa  47.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 1247 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  37.21 
 
 		 683 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 673 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  31.25 
 
 		 409 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  32.2 
 
 		 490 aa  47  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  38.71 
 
 		 492 aa  46.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  27.91 
 
 		 1199 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  33.33 
 
 		 680 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  26.2 
 
 		 1113 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 471 aa  45.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  22.29 
 
 		 1537 aa  44.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>