138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2155 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
649 aa  1313    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.03 
 
 
795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  36.01 
 
 
640 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  36.69 
 
 
600 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.45 
 
 
326 aa  207  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  37.88 
 
 
570 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  34.31 
 
 
637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.79 
 
 
706 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.43 
 
 
619 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.14 
 
 
749 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.08 
 
 
769 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  35.69 
 
 
962 aa  142  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.32 
 
 
600 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.83 
 
 
1312 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  34.31 
 
 
1045 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  34.65 
 
 
688 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.77 
 
 
871 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  32.28 
 
 
1916 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.43 
 
 
1550 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.18 
 
 
860 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.71 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.58 
 
 
885 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.67 
 
 
847 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.33 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.68 
 
 
2884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  31.77 
 
 
1452 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
1192 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  29.64 
 
 
1037 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  30.35 
 
 
976 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.8 
 
 
448 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.21 
 
 
530 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  31.52 
 
 
554 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  30.3 
 
 
998 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  27.96 
 
 
538 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.63 
 
 
1412 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.72 
 
 
342 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.17 
 
 
1073 aa  102  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.16 
 
 
624 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  32.86 
 
 
370 aa  97.8  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.77 
 
 
833 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.08 
 
 
1059 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  28.03 
 
 
635 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.63 
 
 
905 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  27.35 
 
 
589 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
848 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.19 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.91 
 
 
442 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.56 
 
 
386 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  28.74 
 
 
661 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.77 
 
 
682 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  26.76 
 
 
678 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.88 
 
 
600 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.52 
 
 
1135 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.79 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.96 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  32.18 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  24.62 
 
 
688 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.15 
 
 
684 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.14 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.02 
 
 
841 aa  75.5  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  25.16 
 
 
643 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.39 
 
 
719 aa  73.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  26.73 
 
 
714 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.28 
 
 
627 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.8 
 
 
609 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.21 
 
 
527 aa  71.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.64 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  27.74 
 
 
779 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  28.05 
 
 
1065 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.5 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  26.75 
 
 
667 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  24.92 
 
 
663 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.97 
 
 
683 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.58 
 
 
656 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.78 
 
 
782 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  24.25 
 
 
444 aa  62  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  25.8 
 
 
1247 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  26.01 
 
 
404 aa  61.2  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  28.94 
 
 
656 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  25.16 
 
 
1042 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 
999 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  29.49 
 
 
692 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  26.5 
 
 
1248 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  27.17 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  30.23 
 
 
1160 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  27.17 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  28.67 
 
 
673 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.61 
 
 
2286 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  24.91 
 
 
741 aa  57.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  26.87 
 
 
330 aa  57.4  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.46 
 
 
1295 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 
211 aa  57.4  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.63 
 
 
455 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.91 
 
 
2068 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.61 
 
 
363 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  27.81 
 
 
455 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.57 
 
 
3802 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  27.57 
 
 
455 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  24.53 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24.29 
 
 
410 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>