93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1569 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 1113 aa  2302    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  26.66 
 
 		 1055 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.9 
 
 		 2172 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  27.99 
 
 		 811 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  27.55 
 
 		 570 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  24.65 
 
 		 1042 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  28.69 
 
 		 561 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  31.17 
 
 		 667 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  25.21 
 
 		 778 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  24.43 
 
 		 919 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  27.06 
 
 		 868 aa  97.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  38.16 
 
 		 1042 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  38.67 
 
 		 480 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  26.47 
 
 		 866 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  36.95 
 
 		 1199 aa  85.5  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.21 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.28 
 
 		 1380 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  31.28 
 
 		 1363 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.89 
 
 		 1628 aa  80.1  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  24.05 
 
 		 818 aa  79.7  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  46.05 
 
 		 792 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  30.21 
 
 		 1363 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.6 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  37.22 
 
 		 1462 aa  75.1  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.46 
 
 		 2068 aa  74.7  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  49.21 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  31.55 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  49.09 
 
 		 846 aa  72  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  49.09 
 
 		 848 aa  72  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.48 
 
 		 3802 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  29.51 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  31.1 
 
 		 1272 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  40.98 
 
 		 846 aa  63.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 1973 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  32 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  32.97 
 
 		 3507 aa  61.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.7 
 
 		 9585 aa  61.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  39.56 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.93 
 
 		 4433 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  27.7 
 
 		 999 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  29.34 
 
 		 771 aa  56.2  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  27.92 
 
 		 683 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 1735 aa  55.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 995 aa  55.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  28.75 
 
 		 825 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  37.74 
 
 		 409 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  29.47 
 
 		 1299 aa  53.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  30.1 
 
 		 861 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  29.95 
 
 		 1160 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  30.14 
 
 		 781 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  22.86 
 
 		 2170 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1242 aa  52.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  31.91 
 
 		 2286 aa  52.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 459 aa  52  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  44.26 
 
 		 1204 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  30.43 
 
 		 1299 aa  51.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  41.82 
 
 		 972 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.94 
 
 		 455 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  31.97 
 
 		 2334 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  25.52 
 
 		 701 aa  50.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  24.71 
 
 		 680 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  30.12 
 
 		 741 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.74 
 
 		 455 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.74 
 
 		 455 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  38.6 
 
 		 543 aa  48.5  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  28.83 
 
 		 1377 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  24.68 
 
 		 404 aa  47.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  22.32 
 
 		 354 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24.76 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  38.89 
 
 		 1847 aa  47.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30.32 
 
 		 1067 aa  47.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 673 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  26.4 
 
 		 455 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  29.19 
 
 		 211 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  32.2 
 
 		 1303 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  25.67 
 
 		 455 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  25.28 
 
 		 670 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  24.75 
 
 		 455 aa  46.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 705 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.93 
 
 		 743 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  25.24 
 
 		 410 aa  45.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 776 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  29.71 
 
 		 656 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  26.32 
 
 		 715 aa  45.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  35.58 
 
 		 972 aa  45.4  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  29.49 
 
 		 662 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 841 aa  45.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  47.92 
 
 		 310 aa  45.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.65 
 
 		 782 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  24.43 
 
 		 1430 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  31.96 
 
 		 744 aa  45.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  30.82 
 
 		 804 aa  44.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  32.84 
 
 		 478 aa  44.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>