14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0129 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  100 
 
 		 667 aa  1370    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  48.34 
 
 		 919 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  39.32 
 
 		 868 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  32.31 
 
 		 811 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  36.56 
 
 		 818 aa  262  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  31.93 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 1055 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  34.65 
 
 		 866 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  26.54 
 
 		 1042 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  29.97 
 
 		 778 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  28.89 
 
 		 561 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.87 
 
 		 2172 aa  147  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  32.04 
 
 		 1113 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  22.92 
 
 		 781 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>