85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3317 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  100 
 
 		 811 aa  1630    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  40.67 
 
 		 570 aa  353  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 1055 aa  330  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  32.7 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  33.13 
 
 		 1042 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  34.01 
 
 		 919 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  30.69 
 
 		 561 aa  218  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  35.01 
 
 		 778 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  34.19 
 
 		 818 aa  208  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.42 
 
 		 2172 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  32.56 
 
 		 868 aa  168  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  27.78 
 
 		 1113 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  33.63 
 
 		 866 aa  131  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  50 
 
 		 496 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  48.19 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  40 
 
 		 389 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  29.38 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  40.85 
 
 		 351 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  30.77 
 
 		 572 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.08 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  31.76 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  32.08 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  40 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  36.59 
 
 		 468 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 628 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  36.11 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  37.5 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  36.99 
 
 		 609 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 		 984 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  35.44 
 
 		 1298 aa  52.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 		 1209 aa  51.6  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  38.89 
 
 		 727 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  36.23 
 
 		 1186 aa  51.2  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  35.44 
 
 		 763 aa  50.8  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 		 1137 aa  50.8  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 608 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  37.8 
 
 		 688 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  39.13 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.13 
 
 		 767 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  37.8 
 
 		 518 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  42.25 
 
 		 446 aa  48.9  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  34.21 
 
 		 460 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.74 
 
 		 429 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.58 
 
 		 459 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  44.64 
 
 		 1112 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 		 812 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  37.14 
 
 		 403 aa  48.5  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  29.87 
 
 		 511 aa  48.5  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.49 
 
 		 778 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  56.1 
 
 		 1328 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.99 
 
 		 590 aa  48.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.33 
 
 		 743 aa  47.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 562 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  32.91 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.06 
 
 		 479 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  38.03 
 
 		 925 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  36.99 
 
 		 773 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  34.29 
 
 		 442 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  33.78 
 
 		 938 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.62 
 
 		 588 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  38.57 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.51 
 
 		 973 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  33.78 
 
 		 376 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  34.57 
 
 		 842 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  30.49 
 
 		 1007 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 486 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  38.89 
 
 		 494 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  34.29 
 
 		 514 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  35.85 
 
 		 1121 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  32.1 
 
 		 906 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  31.51 
 
 		 894 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 725 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1685  peptidase S26B, signal peptidase  34.29 
 
 		 638 aa  45.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 846 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.43 
 
 		 2305 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 633 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  31.17 
 
 		 596 aa  44.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  36.62 
 
 		 420 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  32.43 
 
 		 700 aa  44.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 459 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  34.67 
 
 		 467 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  37.68 
 
 		 488 aa  44.3  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1767  putative autotransporter  54.76 
 
 		 1984 aa  44.3  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  34.29 
 
 		 393 aa  44.3  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>