18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0031 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  100 
 
 		 570 aa  1172    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  41.33 
 
 		 811 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 1055 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  33.13 
 
 		 919 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  32.38 
 
 		 1042 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  31.61 
 
 		 561 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  31.93 
 
 		 667 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  29.08 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.12 
 
 		 2172 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  29.37 
 
 		 818 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  30.18 
 
 		 868 aa  173  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  28.02 
 
 		 1113 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  26.17 
 
 		 866 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  24.4 
 
 		 781 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  30 
 
 		 500 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  30.71 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  30 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  30 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>