16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0931 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  100 
 
 
868 aa  1791    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  39.47 
 
 
818 aa  303  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  34.25 
 
 
919 aa  284  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  39.32 
 
 
667 aa  281  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  35.5 
 
 
866 aa  267  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  30.6 
 
 
1055 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  32.56 
 
 
811 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  30.02 
 
 
570 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  30.92 
 
 
561 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  27.42 
 
 
778 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  26.01 
 
 
1042 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  27.06 
 
 
1113 aa  97.8  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.28 
 
 
2172 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  26.27 
 
 
781 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  27.97 
 
 
1129 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  25.61 
 
 
468 aa  47.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>