15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0287 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  100 
 
 		 919 aa  1888    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  48.34 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  32.39 
 
 		 818 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  34.25 
 
 		 868 aa  290  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  34.15 
 
 		 811 aa  240  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  32.11 
 
 		 570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  34.11 
 
 		 866 aa  217  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  32.33 
 
 		 561 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 1055 aa  172  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  29.24 
 
 		 778 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  27.27 
 
 		 1042 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.07 
 
 		 2172 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  24.43 
 
 		 1113 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  22.49 
 
 		 781 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2981  MJ0042 family finger-like protein  27.32 
 
 		 777 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>