40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2485 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  100 
 
 		 778 aa  1612    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  34.48 
 
 		 811 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0031  Protein of unknown function DUF1592  28.45 
 
 		 570 aa  187  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5967  Protein of unknown function DUF1592  30.6 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 1055 aa  158  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0287  Protein of unknown function DUF1592  28.57 
 
 		 919 aa  158  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  30.21 
 
 		 1042 aa  150  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0129  Protein of unknown function DUF1592  29.89 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.609629  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  27.42 
 
 		 868 aa  134  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  24.57 
 
 		 818 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3241  Protein of unknown function DUF1588  28.32 
 
 		 866 aa  110  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  25.21 
 
 		 1113 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.76 
 
 		 2172 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  30.87 
 
 		 1141 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.05 
 
 		 1206 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  29.61 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  30.11 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.36 
 
 		 14944 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1264  Protein of unknown function DUF1588  29.44 
 
 		 781 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0322695 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  27.63 
 
 		 978 aa  68.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  29.86 
 
 		 918 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.54 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1504 aa  64.3  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 361 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  22.63 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  25 
 
 		 1314 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  24.68 
 
 		 841 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  29.31 
 
 		 2392 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  28.1 
 
 		 2252 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  32.94 
 
 		 2447 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  26.72 
 
 		 578 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 343 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 995 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  25.86 
 
 		 584 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  25.62 
 
 		 886 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  24.74 
 
 		 902 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  23.57 
 
 		 2215 aa  45.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  29.35 
 
 		 882 aa  45.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  29.35 
 
 		 882 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>