63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1687 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  100 
 
 		 584 aa  1144    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  89.62 
 
 		 578 aa  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  35.07 
 
 		 644 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  41.72 
 
 		 1141 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  35.95 
 
 		 197 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  40.38 
 
 		 841 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  38.27 
 
 		 14944 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  40 
 
 		 1206 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  43.16 
 
 		 613 aa  87.4  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  34.32 
 
 		 978 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  39.13 
 
 		 918 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  29.26 
 
 		 1172 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  37.89 
 
 		 1314 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3943  TadE family protein  38.05 
 
 		 177 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  31.61 
 
 		 2252 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.3 
 
 		 904 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1504 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4465 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  54.32 
 
 		 830 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  34.44 
 
 		 3802 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  31.29 
 
 		 2215 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  52.04 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  32.16 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.32 
 
 		 2313 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 995 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  31.31 
 
 		 772 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.96 
 
 		 1394 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  30.53 
 
 		 551 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.62 
 
 		 453 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  26.62 
 
 		 849 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  30.17 
 
 		 840 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.88 
 
 		 1064 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  48.51 
 
 		 625 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.95 
 
 		 846 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.52 
 
 		 558 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  28.48 
 
 		 2447 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  32.94 
 
 		 423 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  23.81 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.44 
 
 		 671 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  32.14 
 
 		 578 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  50.52 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  45.78 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  27.84 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  36.99 
 
 		 913 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  35.62 
 
 		 913 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  42.73 
 
 		 639 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  61.29 
 
 		 914 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  52.5 
 
 		 456 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  47.56 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  29.05 
 
 		 966 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  55.42 
 
 		 1159 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  60.26 
 
 		 793 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 		 654 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 831 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  28.65 
 
 		 521 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  27.73 
 
 		 778 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.45 
 
 		 875 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0681  hypothetical protein  40.66 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.735733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 338 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  41.88 
 
 		 455 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  40.82 
 
 		 135 aa  43.9  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  37.35 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>