79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2708 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  100 
 
 		 343 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  70.24 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  51.46 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  36.2 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  36.2 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  35.89 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  31.83 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  33.22 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  31.77 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  33.55 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  31.27 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  31.89 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  32 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  30.34 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  34.27 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 269 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  30.83 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  30.42 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  29.39 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  30.45 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  28.03 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  29.5 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  31.04 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  31.55 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  30.75 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  30.75 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  31.94 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  28.62 
 
 		 675 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  32.52 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  31.7 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  28.3 
 
 		 675 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  28.08 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  29.33 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  29.53 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.53 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.53 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  27.09 
 
 		 708 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  30.8 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  31.06 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  27.41 
 
 		 691 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  27.62 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  29.75 
 
 		 669 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  27.85 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.17 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25 
 
 		 699 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  28.22 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  27.8 
 
 		 721 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 721 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  26 
 
 		 698 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.08 
 
 		 689 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  26.27 
 
 		 712 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  27.24 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  28.64 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  27.15 
 
 		 728 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  25.35 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  28.87 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  30.65 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  25.08 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  23.68 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  30 
 
 		 125 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  23.74 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  23.35 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  22.67 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.91 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  28 
 
 		 130 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  36.36 
 
 		 778 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  30.16 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  33.83 
 
 		 664 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  25 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>