120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2757 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  96.59 
 
 
293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  68.46 
 
 
304 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  67.22 
 
 
304 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  67.11 
 
 
304 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  67.45 
 
 
304 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  66.03 
 
 
310 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  55.14 
 
 
327 aa  319  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  57.69 
 
 
313 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  57.92 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  56.15 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  55.39 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  51.33 
 
 
317 aa  299  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  46.06 
 
 
351 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  45.77 
 
 
351 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  45.77 
 
 
351 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  45.77 
 
 
352 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  48.65 
 
 
372 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  47.12 
 
 
346 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  44.38 
 
 
355 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  48.3 
 
 
355 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  43.52 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  46.79 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  43.23 
 
 
355 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  44.31 
 
 
350 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  46.78 
 
 
353 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  48.15 
 
 
282 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  43.63 
 
 
272 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  39.5 
 
 
337 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  43.36 
 
 
327 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  41.15 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  42.92 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  38.22 
 
 
698 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  39.84 
 
 
675 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.37 
 
 
726 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  39.52 
 
 
675 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  37.4 
 
 
708 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  38.49 
 
 
369 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  38.49 
 
 
357 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  35.34 
 
 
306 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  38.43 
 
 
773 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  39.91 
 
 
669 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  37.71 
 
 
358 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  39.57 
 
 
329 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  35.38 
 
 
331 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.78 
 
 
689 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.3 
 
 
699 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  36.86 
 
 
721 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  36.86 
 
 
721 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  37.6 
 
 
728 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  36.86 
 
 
694 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  37.01 
 
 
712 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  37.29 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  36.21 
 
 
691 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  37.44 
 
 
303 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  39.09 
 
 
308 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  37.45 
 
 
333 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  32.18 
 
 
306 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  36.02 
 
 
329 aa  142  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  35.6 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  34.73 
 
 
407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  36.07 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  35.14 
 
 
407 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  29.17 
 
 
315 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  32.24 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  49.57 
 
 
139 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  30.42 
 
 
343 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  30.86 
 
 
363 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  29.96 
 
 
347 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  48.91 
 
 
130 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  52.5 
 
 
125 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  32.81 
 
 
181 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  28.75 
 
 
347 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  42.47 
 
 
79 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  36.75 
 
 
421 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  35.56 
 
 
678 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  31.01 
 
 
430 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  33.33 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  32.26 
 
 
187 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  31.78 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  34.95 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  31.78 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  31.78 
 
 
430 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  26.74 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  36.36 
 
 
409 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  30.39 
 
 
188 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  32.95 
 
 
412 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  31.03 
 
 
171 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  35.06 
 
 
424 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  25.81 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  31.43 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.91 
 
 
447 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  27.01 
 
 
344 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  31.91 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  26.28 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  30.08 
 
 
180 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  29.7 
 
 
664 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>