97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2825 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  100 
 
 		 329 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  48.21 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  49.32 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  49.46 
 
 		 331 aa  288  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  44.83 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  47.37 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  41.07 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  41.09 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  42.07 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  42.71 
 
 		 269 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  38.3 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  38.32 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  39.41 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  40.55 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  38.99 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  40.95 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.15 
 
 		 726 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  40.95 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  38.33 
 
 		 728 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  42.15 
 
 		 773 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  38.91 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  42.08 
 
 		 675 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  43.44 
 
 		 708 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  41.63 
 
 		 675 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  40.08 
 
 		 721 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  40.08 
 
 		 694 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.08 
 
 		 699 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.7 
 
 		 669 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 698 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  39.66 
 
 		 721 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  38.49 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  31.69 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  37.39 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  38.91 
 
 		 691 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.37 
 
 		 712 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  34.97 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  33.22 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  37.07 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.91 
 
 		 689 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  32.88 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  32.16 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  33.58 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  33.22 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  45.99 
 
 		 181 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  33.57 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  31.8 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 347 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  36.74 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  31.1 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  30.04 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  32.61 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  37.26 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  30.04 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  38.61 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  31.97 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  47.97 
 
 		 125 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  36.87 
 
 		 671 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  45.83 
 
 		 139 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  43.33 
 
 		 130 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  50 
 
 		 79 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  32.32 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  32.69 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  29.51 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  28.57 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  26.21 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  31.17 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.03 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.03 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  37.63 
 
 		 107 aa  45.8  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  29.07 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  25.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  25.44 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0234  hypothetical protein  38.75 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  31.36 
 
 		 195 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  24.83 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2855  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  36.11 
 
 		 225 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2136  hypothetical protein  28.75 
 
 		 87 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  24.56 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  28.89 
 
 		 145 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>