83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0653 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  100 
 
 		 130 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  87.69 
 
 		 694 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  87.69 
 
 		 721 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  86.15 
 
 		 721 aa  246  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  80 
 
 		 728 aa  229  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  77.69 
 
 		 773 aa  224  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  77.69 
 
 		 726 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  78.46 
 
 		 708 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  74.22 
 
 		 698 aa  213  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  76.15 
 
 		 699 aa  213  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  72.31 
 
 		 675 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  71.54 
 
 		 675 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  73.08 
 
 		 712 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  71.54 
 
 		 689 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  70.77 
 
 		 691 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  65.12 
 
 		 669 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  64.06 
 
 		 303 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  62.9 
 
 		 308 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  59.84 
 
 		 311 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  57.69 
 
 		 272 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  56.92 
 
 		 269 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  55.04 
 
 		 327 aa  141  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  54.26 
 
 		 327 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  54.48 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  42.22 
 
 		 369 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  42.22 
 
 		 357 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  50 
 
 		 352 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  44.07 
 
 		 329 aa  94.7  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 327 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  43.33 
 
 		 329 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  47.92 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  48.42 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  47.92 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  47.92 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  41.32 
 
 		 306 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  48.91 
 
 		 291 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  50 
 
 		 310 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  46.32 
 
 		 282 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  47.66 
 
 		 313 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  47.78 
 
 		 293 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  41.53 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  42.86 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 361 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  41.91 
 
 		 333 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  37.98 
 
 		 331 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  36.43 
 
 		 306 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  38.84 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  42.99 
 
 		 343 aa  78.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  43.36 
 
 		 317 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  40.54 
 
 		 352 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 351 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 353 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  40.71 
 
 		 351 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  43.96 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  39 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  40.54 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  44.33 
 
 		 671 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 407 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  39.64 
 
 		 351 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  38.94 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  38.94 
 
 		 355 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  38.94 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  38.39 
 
 		 372 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  36.61 
 
 		 350 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 343 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  33.04 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  28 
 
 		 343 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  23.42 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  31.48 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  31.48 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  31.48 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 303 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 217 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 289 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.79 
 
 		 461 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  29.09 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  45.45 
 
 		 468 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  31.91 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  48.72 
 
 		 325 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  32.22 
 
 		 307 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>