99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2387 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 671 aa  1389    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  32.9 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  32.69 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  32.69 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  32.69 
 
 		 438 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  32.85 
 
 		 446 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  32.61 
 
 		 446 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  33.09 
 
 		 446 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  30.24 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  29.27 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  36.1 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  28.76 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 327 aa  146  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  26.54 
 
 		 627 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  28.17 
 
 		 627 aa  144  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  37.91 
 
 		 269 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 698 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  34.27 
 
 		 773 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  35.4 
 
 		 675 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.82 
 
 		 726 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  35.24 
 
 		 675 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 669 aa  130  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  34.23 
 
 		 352 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  36.74 
 
 		 309 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  32.49 
 
 		 304 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  36.32 
 
 		 313 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 708 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  33.18 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  36.12 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  33.18 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.63 
 
 		 689 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.43 
 
 		 699 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  32.71 
 
 		 304 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 721 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 694 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  33.63 
 
 		 303 aa  124  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  32.55 
 
 		 272 aa  124  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  33.48 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 721 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  32.55 
 
 		 317 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.24 
 
 		 291 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  32.46 
 
 		 306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  34.87 
 
 		 329 aa  112  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  30.25 
 
 		 310 aa  112  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  35.81 
 
 		 337 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  30.2 
 
 		 351 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 333 aa  110  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  31.48 
 
 		 293 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  34.85 
 
 		 358 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 331 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  27.95 
 
 		 355 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  30.2 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 306 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  31.48 
 
 		 327 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 355 aa  107  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  29.02 
 
 		 351 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  29.02 
 
 		 351 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  28.63 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  27.61 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  30.54 
 
 		 407 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  30.71 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  36.87 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  29.02 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 343 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  34.22 
 
 		 282 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  30.43 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  30.43 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  24.15 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  29.02 
 
 		 372 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  29.02 
 
 		 353 aa  95.1  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  26.39 
 
 		 350 aa  90.5  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  27.17 
 
 		 346 aa  87.8  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  30.96 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  27.96 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  44.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  27.08 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  26.49 
 
 		 492 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  26.76 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 139 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  38.68 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  27.1 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  26.15 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  22.67 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  38.27 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  25.62 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3713  hypothetical protein  24.87 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000844508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  24.06 
 
 		 347 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  25 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  25 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  25 
 
 		 347 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  39.71 
 
 		 79 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  25.81 
 
 		 280 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  23.82 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  25.74 
 
 		 263 aa  44.3  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  25.23 
 
 		 484 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>