85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1441 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  100 
 
 		 311 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  57.62 
 
 		 303 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  57.42 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  55.51 
 
 		 675 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  55.73 
 
 		 675 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.97 
 
 		 726 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  52.87 
 
 		 698 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  52.34 
 
 		 773 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.91 
 
 		 699 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  53.17 
 
 		 708 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  52.31 
 
 		 712 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  51.92 
 
 		 691 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  52.34 
 
 		 728 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.31 
 
 		 689 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  51.19 
 
 		 669 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  51.98 
 
 		 721 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  51.56 
 
 		 721 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  51.56 
 
 		 694 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  47.6 
 
 		 272 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  46.59 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  42.57 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  42.97 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  35.84 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  36.39 
 
 		 329 aa  168  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  39.41 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  38.72 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  39.41 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  37.77 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  59.84 
 
 		 130 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  33.84 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  38.08 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  38.08 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  35.55 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  37.29 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  36.53 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  51.7 
 
 		 139 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  37.18 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  37.39 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  33.83 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  33.06 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 407 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  33.06 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  33.05 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  33.2 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  34.33 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  33.47 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  30.71 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  32.64 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  36.28 
 
 		 671 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  31.56 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  26.83 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  30.83 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  30.14 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  28.62 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  28.62 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  28.88 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  28.62 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  28.27 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  29.96 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  28.27 
 
 		 351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  28.27 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  30.62 
 
 		 363 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  25.88 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  28.64 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  34.48 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  43.88 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  49.33 
 
 		 79 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  27.64 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  26.21 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.06 
 
 		 749 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  31.9 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  41.18 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.54 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.03 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  26.77 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  27.91 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>