More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2348 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.11 
 
 
699 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  64.95 
 
 
689 aa  872    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  67.37 
 
 
698 aa  949    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  74.53 
 
 
726 aa  1094    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  99.71 
 
 
721 aa  1418    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  55.91 
 
 
669 aa  798    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  70.9 
 
 
708 aa  999    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  65.61 
 
 
675 aa  950    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  90.4 
 
 
509 aa  867    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  65.2 
 
 
691 aa  882    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  65.96 
 
 
712 aa  900    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  100 
 
 
694 aa  1423    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  73.74 
 
 
773 aa  1099    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  78.24 
 
 
728 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  98.27 
 
 
721 aa  1395    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  65.17 
 
 
675 aa  950    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.18 
 
 
426 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  47.68 
 
 
432 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  47.2 
 
 
432 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.68 
 
 
432 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  47.68 
 
 
432 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.51 
 
 
426 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  47.55 
 
 
450 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  46.84 
 
 
434 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  46.84 
 
 
434 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.67 
 
 
434 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  46.21 
 
 
430 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.36 
 
 
434 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.96 
 
 
441 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  47.17 
 
 
439 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.33 
 
 
417 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.58 
 
 
447 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.84 
 
 
447 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.58 
 
 
447 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  46.08 
 
 
433 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.43 
 
 
417 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.91 
 
 
453 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  45.61 
 
 
463 aa  354  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.72 
 
 
415 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.04 
 
 
448 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.76 
 
 
448 aa  352  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.76 
 
 
395 aa  351  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.28 
 
 
422 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  47.2 
 
 
439 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.62 
 
 
448 aa  349  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  46.65 
 
 
439 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  45.28 
 
 
439 aa  348  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  46.59 
 
 
447 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  45.85 
 
 
434 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.3 
 
 
440 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  46.57 
 
 
415 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  45.26 
 
 
432 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.99 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.4 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  44.16 
 
 
438 aa  337  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.63 
 
 
451 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  43.61 
 
 
469 aa  334  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  44.63 
 
 
477 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.55 
 
 
477 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.88 
 
 
537 aa  326  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  41.22 
 
 
450 aa  326  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.52 
 
 
467 aa  326  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  43.13 
 
 
475 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.13 
 
 
475 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  43.13 
 
 
475 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.68 
 
 
469 aa  321  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.26 
 
 
470 aa  321  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  43.14 
 
 
466 aa  318  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  43.36 
 
 
470 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  44.1 
 
 
473 aa  317  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  46.13 
 
 
554 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  42.75 
 
 
476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43 
 
 
433 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.88 
 
 
530 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  44.92 
 
 
650 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  44.92 
 
 
476 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  44.92 
 
 
482 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.69 
 
 
451 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 
527 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  57.14 
 
 
303 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  43.56 
 
 
527 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.29 
 
 
427 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  43.56 
 
 
527 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  42.79 
 
 
429 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 
424 aa  294  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.57 
 
 
427 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 
448 aa  293  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.31 
 
 
444 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  40.2 
 
 
425 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.15 
 
 
425 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 
425 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.15 
 
 
425 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.7 
 
 
425 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  40.33 
 
 
424 aa  289  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.86 
 
 
425 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.99 
 
 
426 aa  287  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  42.24 
 
 
492 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  39.4 
 
 
425 aa  283  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  51.56 
 
 
311 aa  282  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  39.15 
 
 
425 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>