77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1187 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  100 
 
 		 79 aa  167  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  90.79 
 
 		 272 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  81.58 
 
 		 269 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  65.33 
 
 		 773 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  66.67 
 
 		 675 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  64 
 
 		 708 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  65.33 
 
 		 721 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  65.33 
 
 		 675 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  61.33 
 
 		 728 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  64 
 
 		 669 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  64 
 
 		 721 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  64 
 
 		 694 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.33 
 
 		 689 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60 
 
 		 726 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.33 
 
 		 699 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  56.58 
 
 		 327 aa  100  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  57.33 
 
 		 698 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  57.33 
 
 		 712 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  53.95 
 
 		 327 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  56 
 
 		 691 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  52.11 
 
 		 369 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  52.11 
 
 		 357 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 308 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  48.65 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 304 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  48.65 
 
 		 304 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  49.33 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  47.89 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  50 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  49.33 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  48.57 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  52.78 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  44.29 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  47.89 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  52.78 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  52.78 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  51.39 
 
 		 351 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  50 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  50 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  43.84 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 407 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  48.61 
 
 		 351 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 337 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 306 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  39.73 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  45.83 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  48.61 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  47.22 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  43.84 
 
 		 293 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  40 
 
 		 361 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  43.66 
 
 		 333 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  42.47 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  49.28 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  42.65 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  48.33 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  48.33 
 
 		 309 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  45.61 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 327 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  38.98 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  39.71 
 
 		 671 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  35.82 
 
 		 288 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  31.51 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  32 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  33.33 
 
 		 274 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  34.21 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 347 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  36.07 
 
 		 296 aa  40  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>