106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1943 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  100 
 
 
327 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  89.91 
 
 
327 aa  626  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  50.19 
 
 
272 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  50.82 
 
 
269 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  50.22 
 
 
773 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  43.87 
 
 
728 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  51.52 
 
 
708 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  47.98 
 
 
669 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.66 
 
 
726 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 
699 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  50 
 
 
698 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  49.35 
 
 
721 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  49.78 
 
 
721 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  49.78 
 
 
694 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.57 
 
 
689 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  48.72 
 
 
675 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  48.48 
 
 
691 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  47.9 
 
 
675 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  48.31 
 
 
712 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  44.84 
 
 
303 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  42.57 
 
 
311 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  44.07 
 
 
308 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  45.13 
 
 
352 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  43.1 
 
 
327 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  43.86 
 
 
304 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  43.95 
 
 
304 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  40.32 
 
 
329 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  42.98 
 
 
304 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  42.98 
 
 
304 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  42.92 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  38.34 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  42.73 
 
 
293 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  41.44 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  40.32 
 
 
369 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  40.32 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  38.27 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  39.06 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  40.09 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  42.6 
 
 
343 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  36.82 
 
 
317 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  42.52 
 
 
337 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  35.96 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  37.99 
 
 
282 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  36.95 
 
 
329 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  37.25 
 
 
306 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  36.1 
 
 
671 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  34.73 
 
 
351 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  31.92 
 
 
351 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  31.92 
 
 
351 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  32.25 
 
 
352 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  33.59 
 
 
355 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  32.73 
 
 
355 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  32.73 
 
 
355 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  32.82 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  32.73 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  34.34 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  32.93 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  35.32 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  34.85 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  54.26 
 
 
130 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  49.64 
 
 
139 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  32.34 
 
 
350 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  32.95 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  30.92 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  33.98 
 
 
407 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  33.8 
 
 
407 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  31.82 
 
 
343 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  30.35 
 
 
347 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  30.35 
 
 
347 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  30.35 
 
 
347 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  28.03 
 
 
343 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  28.91 
 
 
363 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  26.64 
 
 
347 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  53.95 
 
 
79 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  37.98 
 
 
181 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  48.91 
 
 
125 aa  85.9  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  38.27 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  36.27 
 
 
171 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  32.43 
 
 
211 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  27.27 
 
 
145 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  25.83 
 
 
288 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  28.44 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  28.44 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  32.58 
 
 
468 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  30.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.67 
 
 
294 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.67 
 
 
294 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  30.84 
 
 
342 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  30.77 
 
 
242 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.5 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  26.42 
 
 
131 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  26.8 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  29.29 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.68 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  29.13 
 
 
194 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  27.38 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  23.39 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  29.63 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  24.43 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>