92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4873 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  100 
 
 		 306 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  74.91 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  54.42 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  42.35 
 
 		 361 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  42.21 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  42.45 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  41.64 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  40.42 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  38.13 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  38.78 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  39 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  39.51 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  38.2 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  37.8 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  38.27 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  37.34 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  34.16 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  35.34 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 355 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 355 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  35.23 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  35.23 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.31 
 
 		 669 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  35.38 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  36.6 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  34.88 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  34.88 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  36.6 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  35.68 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  41.78 
 
 		 773 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  36.43 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  37.35 
 
 		 721 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  39.06 
 
 		 708 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  36.95 
 
 		 721 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  36.95 
 
 		 694 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.55 
 
 		 689 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  36 
 
 		 728 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 691 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  33.7 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.37 
 
 		 699 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.17 
 
 		 726 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  36.33 
 
 		 675 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  35.55 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  33.86 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 698 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  35.57 
 
 		 675 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  36.33 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  33.33 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 712 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  34.6 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  31.77 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  32.73 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  30.47 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  33.07 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  33.07 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  32.68 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  35.45 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 343 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  34.47 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  48.78 
 
 		 125 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  31.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  31.82 
 
 		 671 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  41.32 
 
 		 130 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.46 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  38.52 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  41.1 
 
 		 79 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  43.55 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  28.48 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.11 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  33.57 
 
 		 647 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  33.03 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.06 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.62 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.62 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  34.41 
 
 		 632 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  24.6 
 
 		 652 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  41.82 
 
 		 775 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  29.01 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  32.23 
 
 		 647 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  37.1 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  25.84 
 
 		 145 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  27.2 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>