104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0286 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  100 
 
 		 329 aa  685    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  44.92 
 
 		 331 aa  275  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  47.64 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  44.73 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  45.16 
 
 		 357 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  41.64 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  39.01 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  56.67 
 
 		 181 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  43.53 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  44.31 
 
 		 269 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  38.13 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  39.35 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 		 726 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  38.02 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  68.25 
 
 		 125 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  42.46 
 
 		 773 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.06 
 
 		 689 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  42.4 
 
 		 708 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  40.93 
 
 		 669 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.45 
 
 		 712 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  42.48 
 
 		 728 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.64 
 
 		 675 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  43.35 
 
 		 698 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  39.25 
 
 		 675 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  40.32 
 
 		 721 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  40.32 
 
 		 694 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  37.59 
 
 		 691 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.54 
 
 		 699 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  39.52 
 
 		 721 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  40.17 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  36.39 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  34.95 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  34.95 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  36.95 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  37.75 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  39.26 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  30.06 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  35.89 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  37.99 
 
 		 407 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  36.91 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  37.12 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  33.22 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  35.83 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  31.99 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  38.78 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  36.02 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  34.32 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  32.1 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  36.17 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  32.89 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  29.72 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  34.82 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  29.25 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  30.98 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  31.41 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  28.25 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  31.23 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  27.98 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  28.25 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  31.73 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  34.87 
 
 		 671 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  31.67 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 139 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  44.07 
 
 		 130 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  47.89 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  34.04 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  29.58 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  34.31 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  27.4 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  26.62 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1024  putative periplasmic protein  53.33 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0169283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  29.76 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  37.5 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  37.21 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  30 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  26.02 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  32.97 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  27.97 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  30.88 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  30.88 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  30.88 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2136  hypothetical protein  25.3 
 
 		 87 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  28.89 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  26.02 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.22 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  24.84 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>