68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2761 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  57.58 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  52.53 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  54.01 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  45.85 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  45.61 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  40.35 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  39.66 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  37.28 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  34.65 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.81 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.81 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  30.43 
 
 		 282 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  30.94 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  31.14 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  27.52 
 
 		 268 aa  99  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  29.74 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.44 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  27.43 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  28.44 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  28.15 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.52 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  26.58 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  27.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  28.64 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  27.62 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  26.72 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  26.15 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  26.43 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  27.73 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  28.19 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  28.19 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.67 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  23.94 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  27.27 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  28.63 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  25.55 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  25.99 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  29.58 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  27.45 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.64 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  23.89 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  25.76 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  26.42 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  23.38 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  26.11 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  27.39 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  26.88 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  24.53 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  25.78 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  26.16 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  29.27 
 
 		 675 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  23.81 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  24.72 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 407 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  32.95 
 
 		 343 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  26.83 
 
 		 675 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  28 
 
 		 669 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0297  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.94 
 
 		 753 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  25.66 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  25 
 
 		 773 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  25.2 
 
 		 721 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  26.57 
 
 		 728 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  25 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>