58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0814 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  100 
 
 		 285 aa  594  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  74.04 
 
 		 285 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  51.26 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  46.79 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  48.63 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  46.24 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  44.64 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  43.9 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  37.59 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  40.94 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  33.47 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  36 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  32.55 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  32.58 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  30.81 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.57 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.57 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  29.55 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  33.49 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  30.59 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  30.99 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  28.44 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  29.03 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.71 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.81 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  31.68 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.25 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  27.03 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  26.15 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  25.51 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  26.15 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  25.95 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  25.13 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  26.77 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  28.47 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  28.47 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  28.47 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  24.84 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  28.48 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  31.29 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  30.1 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  28.1 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  29.5 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  25.51 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  31.9 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  21.95 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  28.43 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  21.48 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.78 
 
 		 726 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.29 
 
 		 689 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  29.55 
 
 		 181 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  30.56 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  22.6 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  37.25 
 
 		 369 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  37.25 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  27.74 
 
 		 708 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>