61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4162 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  64.1 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  60.21 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  59.3 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  60.42 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  63.1 
 
 		 260 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  56.91 
 
 		 211 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  51.34 
 
 		 342 aa  232  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  48.89 
 
 		 382 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  51.18 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  53.09 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  50.59 
 
 		 194 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  49.72 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  45.21 
 
 		 259 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  52.38 
 
 		 181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  48.9 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  49.32 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  41.63 
 
 		 382 aa  153  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  47.95 
 
 		 180 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  46.3 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  50 
 
 		 180 aa  148  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  46.31 
 
 		 195 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  45.93 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  45.93 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  51.8 
 
 		 174 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  48.12 
 
 		 171 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  42.46 
 
 		 348 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  44.03 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  42.42 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  45.03 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 404 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  42.94 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  37.44 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 360 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  38.28 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  39.23 
 
 		 346 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  39.29 
 
 		 355 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  38.25 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  37.79 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  37.79 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  35.64 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  40 
 
 		 187 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  36.57 
 
 		 331 aa  92.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  32.03 
 
 		 310 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 331 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 327 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  33 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  35.45 
 
 		 329 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 353 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  30.12 
 
 		 347 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.95 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  28.09 
 
 		 327 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  29.59 
 
 		 363 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  30.12 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  30.12 
 
 		 347 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  30.7 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>