16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2136 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2136  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  183  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1740  cytochrome c family protein, putative  59.3 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0578464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0310  C-type cytochrome, putative  45.24 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000114661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0322  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0739887  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0350  hypothetical protein  39.02 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  33.33 
 
 		 300 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  30.21 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0961  hypothetical protein  36.26 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  26.25 
 
 		 329 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  27.63 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  28.75 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  30.38 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  43.75 
 
 		 773 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  27.27 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  27.96 
 
 		 272 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>