More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4643 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 361 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  42.13 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 		 241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.71 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  40.83 
 
 		 1141 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  47.75 
 
 		 510 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  50.89 
 
 		 670 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  48.65 
 
 		 517 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  29.12 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  50.88 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  34.35 
 
 		 644 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 630 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  45.83 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 704 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.25 
 
 		 904 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 217 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 		 217 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.9 
 
 		 209 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  43.93 
 
 		 620 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.86 
 
 		 631 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  42.86 
 
 		 380 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  31.21 
 
 		 978 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 537 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  45.05 
 
 		 640 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.83 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 638 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 658 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  44.14 
 
 		 641 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  45.05 
 
 		 694 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 193 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  42.2 
 
 		 656 aa  89.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  42.34 
 
 		 1313 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 648 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  30.83 
 
 		 841 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  45.19 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.58 
 
 		 218 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38.68 
 
 		 311 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 631 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 673 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  38.35 
 
 		 586 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 		 14944 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  30.16 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.98 
 
 		 226 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.88 
 
 		 464 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.58 
 
 		 707 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.52 
 
 		 407 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.6 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.28 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.27 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  34.11 
 
 		 4465 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.28 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  31.75 
 
 		 613 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.35 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  40.78 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  38.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  38.68 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.84 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  38.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  38.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  38.68 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  38.68 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  38.68 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  34.88 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  39.42 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36.88 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  40.78 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  35.66 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 230 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>