More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3949 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 		 407 aa  848    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  49.06 
 
 		 620 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  51.79 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  50.5 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  41.53 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  50.5 
 
 		 260 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  43.09 
 
 		 694 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  46.22 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  49.5 
 
 		 218 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  48.51 
 
 		 240 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  51.49 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  52.94 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 263 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 321 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 263 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 189 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  46.15 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 166 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  48.04 
 
 		 233 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 209 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 262 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 209 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 468 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  48.51 
 
 		 209 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  45.54 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 631 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  43.7 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  42.86 
 
 		 631 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  37.5 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  48.54 
 
 		 219 aa  97.1  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  43.59 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 217 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.5 
 
 		 217 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 466 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  46.9 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.76 
 
 		 630 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 218 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 317 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.85 
 
 		 525 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.66 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 		 218 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 239 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  47.06 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  49.5 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50.49 
 
 		 607 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 219 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 242 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  49.5 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  40.87 
 
 		 640 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  48.51 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.87 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  48.51 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  48.51 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.31 
 
 		 261 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.31 
 
 		 261 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  48.51 
 
 		 344 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 219 aa  92.8  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 294 aa  93.2  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 454 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  49.5 
 
 		 327 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 205 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 217 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  46.08 
 
 		 223 aa  92  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  47.52 
 
 		 212 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 230 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 193 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  39.69 
 
 		 277 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.52 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  48.15 
 
 		 231 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  47.52 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 679 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.63 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 210 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.59 
 
 		 217 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  42.99 
 
 		 669 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  47.52 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>