More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0221 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 345 aa  705    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  65.94 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  50.72 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  43.95 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.82 
 
 		 428 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.79 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  50.4 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.09 
 
 		 239 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.95 
 
 		 210 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.95 
 
 		 210 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  46.28 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.99 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  44.76 
 
 		 215 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 213 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.91 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.66 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.91 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.4 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 224 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 224 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 230 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 230 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  46.36 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  34.73 
 
 		 729 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.27 
 
 		 218 aa  85.9  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.93 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  46.67 
 
 		 225 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.4 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.48 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  40.37 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  42.59 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.8 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.73 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.46 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  62.69 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  40.54 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  62.69 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  48.65 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  62.69 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  45.63 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.58 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 1026 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  52.7 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.37 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.86 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  59.7 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.91 
 
 		 641 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  42.73 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  36.69 
 
 		 642 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.86 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  54.41 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  42.86 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  54.41 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.46 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.23 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  34.26 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  58.57 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  62.69 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  54.41 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  35.97 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  34.38 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.18 
 
 		 673 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.75 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  45.78 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.09 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  35.06 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 1755 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>