More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1976 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 331 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  43.77 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.73 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.92 
 
 		 376 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.23 
 
 		 294 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 230 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 230 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  45.87 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  44.83 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  30.1 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.95 
 
 		 210 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.95 
 
 		 210 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  31.61 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.99 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 231 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  45.54 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.23 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 172 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  42.11 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  30.97 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.12 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.88 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.48 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.19 
 
 		 613 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.96 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  36.84 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.12 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.57 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  34.56 
 
 		 679 aa  79.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  33.56 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.84 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  39.42 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 210 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 200 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.82 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 671 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 172 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  46.51 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.28 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.9 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.79 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.86 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.9 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.62 
 
 		 631 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.29 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  35.58 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  41.9 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.78 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.78 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.27 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.69 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  40.54 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.9 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.94 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.94 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  33.94 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>