More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2341 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  67.32 
 
 
228 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  64.09 
 
 
228 aa  254  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  64.71 
 
 
224 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.81 
 
 
241 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
231 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.91 
 
 
236 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.31 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  42.01 
 
 
233 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.44 
 
 
233 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.73 
 
 
218 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 
229 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.11 
 
 
209 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.61 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  45.03 
 
 
263 aa  118  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  42.86 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  41.83 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.42 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.47 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  41.5 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.71 
 
 
230 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  42.07 
 
 
229 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
221 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  41.47 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.13 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  34.7 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.15 
 
 
223 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.13 
 
 
243 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
220 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.5 
 
 
219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  45.52 
 
 
229 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.5 
 
 
219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  43.98 
 
 
222 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  44.29 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  44.29 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  45.45 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  43.45 
 
 
229 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.78 
 
 
225 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
236 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  41.14 
 
 
223 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  39.22 
 
 
225 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.69 
 
 
230 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
219 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  41.55 
 
 
229 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
216 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
216 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
218 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 
218 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.5 
 
 
219 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  39.07 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  40.85 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  40.39 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  41.98 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.85 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.86 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.5 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  38.85 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  38.85 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  38.85 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  41.99 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.44 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  39.57 
 
 
221 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.63 
 
 
294 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.13 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  35.14 
 
 
222 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 
205 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.32 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.15 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.15 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.15 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.15 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  38.13 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  36.82 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.59 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  37.41 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
376 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  36.55 
 
 
238 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.16 
 
 
286 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>