More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4294 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  94.56 
 
 		 264 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  94.56 
 
 		 239 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  77.82 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  67.78 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  61.7 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.93 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.93 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.5 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.62 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.13 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  43.21 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  44.38 
 
 		 344 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.95 
 
 		 350 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.95 
 
 		 350 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.83 
 
 		 429 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.62 
 
 		 420 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  44.38 
 
 		 345 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.38 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.03 
 
 		 337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.75 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.03 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.38 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 445 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.38 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.79 
 
 		 447 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.12 
 
 		 344 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  50 
 
 		 415 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.73 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.01 
 
 		 427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.5 
 
 		 351 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.22 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 623 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 1755 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.09 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.54 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.12 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  52.53 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 440 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 335 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  35.67 
 
 		 369 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 		 369 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.1 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.37 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.82 
 
 		 607 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.47 
 
 		 445 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  39.42 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.36 
 
 		 402 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  49.53 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.51 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 417 aa  101  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  47.62 
 
 		 334 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.53 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.4 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  49.56 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  30.47 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.74 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  45 
 
 		 355 aa  99  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.98 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 		 372 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  51.43 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  46.02 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  42.98 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.42 
 
 		 352 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  34.39 
 
 		 372 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 		 373 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.39 
 
 		 366 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>