More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0441 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 417 aa  854    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  49.16 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.43 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.05 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.47 
 
 		 420 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  55.78 
 
 		 428 aa  239  9e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  34.05 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.6 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.45 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  51 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.38 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.44 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  68.97 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  69.57 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  36.99 
 
 		 290 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  67.8 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  67.8 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.76 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  42.92 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.47 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  30.48 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.67 
 
 		 542 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  35.46 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.4 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  29.6 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 543 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.98 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  46.98 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  56.03 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.31 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.31 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.98 
 
 		 344 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.31 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.31 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  46.31 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.22 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  47.92 
 
 		 209 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.64 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.22 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 		 727 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  29.88 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  29.32 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.28 
 
 		 351 aa  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  30.42 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.42 
 
 		 623 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  42.08 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  44.44 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  59.43 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.98 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  44.97 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1987 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.97 
 
 		 1755 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  38.01 
 
 		 352 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.41 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  49.64 
 
 		 1707 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  46.09 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.99 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  41.5 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.6 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  39.46 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  42.18 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.42 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.06 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.85 
 
 		 240 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.76 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  24.83 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 210 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  36.18 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  36.18 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  40.14 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  39.74 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.86 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  27.74 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.05 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>