More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0372 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  90.43 
 
 
394 aa  727    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  100 
 
 
392 aa  805    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  71.25 
 
 
403 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.29 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35 
 
 
344 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.32 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.62 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.84 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.84 
 
 
344 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.84 
 
 
344 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.75 
 
 
351 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 
401 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  50.58 
 
 
447 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.44 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.44 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  51.23 
 
 
429 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.87 
 
 
381 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  41.24 
 
 
218 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.12 
 
 
345 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.6 
 
 
417 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  45.45 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  38.74 
 
 
352 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.1 
 
 
337 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  46.84 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.7 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.84 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.63 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.31 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  35.95 
 
 
367 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  37.5 
 
 
194 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.86 
 
 
209 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
376 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  41.67 
 
 
232 aa  126  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  42.04 
 
 
213 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 
468 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  28.65 
 
 
366 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.86 
 
 
201 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  45.39 
 
 
376 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.04 
 
 
333 aa  123  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.77 
 
 
420 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 
375 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  41.67 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.98 
 
 
466 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  34.76 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 
359 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  39.74 
 
 
373 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.94 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
201 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  27.3 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.07 
 
 
466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  41.18 
 
 
201 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 
201 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.21 
 
 
240 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  32.02 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 
200 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  37.43 
 
 
201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  39.22 
 
 
201 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  29.41 
 
 
457 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 
363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  40.25 
 
 
201 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  30.8 
 
 
367 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 
440 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 
445 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.5 
 
 
369 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.58 
 
 
370 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 
372 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
202 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
202 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  40 
 
 
204 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.53 
 
 
373 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30.96 
 
 
369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30.96 
 
 
369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.62 
 
 
210 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  38.56 
 
 
201 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  39.35 
 
 
202 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 
202 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  49.56 
 
 
454 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.26 
 
 
478 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 
366 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  30.8 
 
 
372 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 
185 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.71 
 
 
327 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
202 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
202 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 
375 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.19 
 
 
375 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  49.56 
 
 
459 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  32.74 
 
 
319 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  35.76 
 
 
208 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  37.42 
 
 
202 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
434 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 
314 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  31.67 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  37.91 
 
 
204 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  39.86 
 
 
348 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  48.67 
 
 
459 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  44.9 
 
 
510 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.1 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  50.89 
 
 
226 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>