More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1901 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
335 aa  684    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  47.25 
 
 
345 aa  311  9e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  49.85 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  49.43 
 
 
337 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  50.88 
 
 
337 aa  292  5e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  41.84 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  39.1 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  38.81 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  37.54 
 
 
319 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  44.01 
 
 
344 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.82 
 
 
344 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  39.7 
 
 
348 aa  191  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.65 
 
 
345 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.96 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.73 
 
 
344 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.73 
 
 
344 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.73 
 
 
344 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.74 
 
 
350 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.74 
 
 
350 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.1 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.17 
 
 
427 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  47.31 
 
 
420 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 
403 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.57 
 
 
417 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  55.56 
 
 
429 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  55 
 
 
447 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  55.24 
 
 
375 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.8 
 
 
392 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  31.31 
 
 
401 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.98 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  30.56 
 
 
466 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.8 
 
 
394 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  52.45 
 
 
376 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  27.76 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  36 
 
 
367 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.51 
 
 
240 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 
466 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  29.31 
 
 
459 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.51 
 
 
369 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 
369 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.05 
 
 
445 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 
366 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 
209 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  36.04 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.38 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 
428 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  35.15 
 
 
372 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 
363 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  29.89 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  32.2 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  32.53 
 
 
368 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  58.49 
 
 
210 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  30.13 
 
 
375 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  37.23 
 
 
327 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  32.65 
 
 
377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.3 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  31.07 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  33.05 
 
 
348 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  37.42 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.64 
 
 
231 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.36 
 
 
230 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 
367 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  27.15 
 
 
366 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
244 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.34 
 
 
319 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  51 
 
 
261 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  51 
 
 
261 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  27.91 
 
 
365 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 
239 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 
216 aa  105  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
440 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.21 
 
 
266 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  28.42 
 
 
376 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 
510 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  27.01 
 
 
368 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  49 
 
 
223 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.59 
 
 
261 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  29.71 
 
 
373 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
239 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  35.92 
 
 
208 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.6 
 
 
217 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.59 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.6 
 
 
217 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 
217 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  44.44 
 
 
481 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
261 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 
262 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>