More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0070 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 458 aa  912    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  46.96 
 
 		 1987 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 637 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 		 623 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 1755 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.64 
 
 		 543 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.89 
 
 		 319 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.06 
 
 		 542 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.22 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.55 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.09 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.56 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.01 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.15 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.75 
 
 		 727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 1264 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6462  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.09 
 
 		 320 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.47 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.71 
 
 		 506 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.32 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.85 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30.22 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  35.04 
 
 		 671 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 540 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  32.74 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  50.44 
 
 		 792 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 380 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  51.92 
 
 		 729 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  39.24 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.61 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.61 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.46 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  48.04 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 169 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  44.19 
 
 		 722 aa  94.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.18 
 
 		 351 aa  94.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 570 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.46 
 
 		 344 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 525 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 209 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  52.27 
 
 		 630 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  45.98 
 
 		 673 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.82 
 
 		 344 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  48.04 
 
 		 310 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  30.54 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 218 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  45.31 
 
 		 722 aa  91.3  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 320 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  48.04 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  48.04 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  48.04 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  48.04 
 
 		 310 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.18 
 
 		 375 aa  90.5  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.82 
 
 		 345 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.18 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.97 
 
 		 394 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  47.06 
 
 		 310 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.18 
 
 		 344 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.18 
 
 		 344 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.18 
 
 		 344 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.75 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 193 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  47.06 
 
 		 310 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  44.83 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 215 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.33 
 
 		 337 aa  88.2  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 206 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 316 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.24 
 
 		 224 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  42.31 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.58 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>