More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1995 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 388 aa  803    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.54 
 
 		 420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.05 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.96 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.9 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.34 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  34.35 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.96 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.05 
 
 		 466 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.73 
 
 		 381 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.13 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.9 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.52 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  27.11 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.29 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.29 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  34.78 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.16 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.16 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  33.11 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  29.44 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.58 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  27.87 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  43.42 
 
 		 623 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  30.54 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  46.15 
 
 		 510 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.45 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  30.51 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.31 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  43.54 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.85 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  27.25 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.07 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  27.32 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 240 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  27.32 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.38 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  27.32 
 
 		 344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  27.65 
 
 		 359 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.83 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.07 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 322 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  44.54 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.84 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.66 
 
 		 209 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  29.83 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.14 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.54 
 
 		 620 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  26.78 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.61 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.13 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  44.09 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  25.54 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 230 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  25.54 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 630 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.48 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.45 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 237 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  45.37 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  32.28 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  29.23 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  33.57 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  47.12 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 727 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 319 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.12 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>