More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6431 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 449 aa  927    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  53.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  27.5 
 
 		 502 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.64 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.6 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.14 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  41.14 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 543 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.31 
 
 		 294 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  28.17 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 237 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.01 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.51 
 
 		 240 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 1026 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.53 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.43 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.93 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 525 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.5 
 
 		 350 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.51 
 
 		 320 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.5 
 
 		 350 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 189 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  38.32 
 
 		 196 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 196 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.28 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  34.91 
 
 		 351 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  34.52 
 
 		 198 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.26 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.45 
 
 		 694 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  36.2 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 191 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.98 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.98 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.98 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  33.51 
 
 		 402 aa  97.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 333 aa  97.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 196 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  34.5 
 
 		 345 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 196 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 196 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 196 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  45.28 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.59 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.62 
 
 		 220 aa  96.3  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.03 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  27.47 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 190 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.57 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  45.69 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.62 
 
 		 243 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  28.53 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  36.53 
 
 		 191 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  36.53 
 
 		 191 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.58 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.58 
 
 		 337 aa  94.7  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  43.4 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 		 623 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.97 
 
 		 230 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.97 
 
 		 230 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 		 218 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 221 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.71 
 
 		 314 aa  93.6  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 175 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 537 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.47 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.55 
 
 		 337 aa  93.2  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  43.12 
 
 		 670 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 		 209 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.87 
 
 		 230 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  32 
 
 		 266 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  32.32 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 727 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.83 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  42.45 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  36.88 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 637 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 218 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  44.23 
 
 		 233 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 673 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1987 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>