More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3545 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  100 
 
 		 370 aa  761    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  88.56 
 
 		 366 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  85.95 
 
 		 369 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  90.64 
 
 		 372 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  90.37 
 
 		 372 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  92.78 
 
 		 373 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  85.71 
 
 		 363 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  83.24 
 
 		 369 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  83.24 
 
 		 369 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  63.88 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  63.61 
 
 		 367 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  61.29 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  58.76 
 
 		 365 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  59.89 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  59.21 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  57.71 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  34.41 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  32.51 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.28 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.81 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.47 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.05 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.97 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.97 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.97 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.49 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.74 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.74 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.82 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  43.42 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  41.03 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.21 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.64 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.55 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.14 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  27.85 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.57 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.53 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.73 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  31.3 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  26.77 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.47 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.77 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.35 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  33.68 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  40.14 
 
 		 202 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 202 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  40.67 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.91 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  28.24 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 202 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 185 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.76 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  37.41 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  35.62 
 
 		 201 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 		 468 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 201 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  27.04 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.24 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  38 
 
 		 204 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.21 
 
 		 427 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  35.37 
 
 		 201 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  35.37 
 
 		 208 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.37 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  25.56 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  28.88 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  35.62 
 
 		 212 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  37.65 
 
 		 205 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  27.62 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  27.53 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  37.67 
 
 		 204 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 201 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.12 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  36.05 
 
 		 201 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 201 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  24.01 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  26.74 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  26.35 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 237 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  27.92 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  27.53 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.76 
 
 		 264 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  25.42 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  36.25 
 
 		 204 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.63 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  26.61 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  26.61 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>