More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0378 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  99.01 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  89.6 
 
 
202 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  99.46 
 
 
185 aa  380  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  89.6 
 
 
202 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  89.45 
 
 
202 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  86.14 
 
 
202 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  86.14 
 
 
202 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  87.94 
 
 
201 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  62.38 
 
 
201 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  62.87 
 
 
201 aa  261  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  58.42 
 
 
201 aa  257  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  59.9 
 
 
201 aa  248  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  60.85 
 
 
201 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  55.28 
 
 
200 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  54.05 
 
 
201 aa  210  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.24 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  37.25 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  40.72 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  36 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  32.83 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  33.33 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  38.1 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
403 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.73 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  38.1 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
366 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
373 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  37.42 
 
 
380 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.04 
 
 
350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.04 
 
 
350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40 
 
 
429 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  39.31 
 
 
401 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.38 
 
 
447 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.41 
 
 
351 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
372 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
369 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 
369 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.06 
 
 
394 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  37.87 
 
 
205 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  35.81 
 
 
367 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.67 
 
 
345 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.67 
 
 
381 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
372 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.67 
 
 
344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.36 
 
 
344 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.67 
 
 
344 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.67 
 
 
344 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.05 
 
 
352 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  35.81 
 
 
373 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  38.06 
 
 
392 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.36 
 
 
344 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 
369 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
363 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  35.81 
 
 
367 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.26 
 
 
377 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.99 
 
 
345 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  36.05 
 
 
368 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 
376 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  35.9 
 
 
368 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 
365 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 
314 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.25 
 
 
367 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 
376 aa  97.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  43.27 
 
 
457 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.33 
 
 
319 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43.27 
 
 
466 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.18 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  36.3 
 
 
366 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 
375 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 
417 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.2 
 
 
327 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.87 
 
 
337 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
454 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 
468 aa  91.3  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
359 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 
466 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.87 
 
 
337 aa  90.1  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 
510 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.37 
 
 
427 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
223 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 
335 aa  88.2  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  28.41 
 
 
333 aa  88.2  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 
428 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.8 
 
 
420 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 
459 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 
459 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
333 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.16 
 
 
623 aa  85.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
333 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.37 
 
 
478 aa  84.7  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.57 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  36.63 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  35.4 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.78 
 
 
640 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4204  outer membrane protein  30.15 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.255099  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.62 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>