More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0690 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  682    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.87 
 
 		 367 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  34.88 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  32.75 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  35.31 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.04 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  31.5 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  31.12 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  32.37 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  29.38 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  29.38 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  29.38 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.59 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  32.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  32.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  32.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  32.46 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  32.46 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  32.36 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  30.88 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  31.41 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  31.3 
 
 		 369 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  30.9 
 
 		 358 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  30.9 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  31.3 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  29.28 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  30.62 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  31.27 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  29.94 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  28.53 
 
 		 361 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.49 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  28.7 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  26.08 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  28.69 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  25.48 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.1 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  26.63 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  27.45 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.81 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  26.54 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  26.54 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.32 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.75 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 		 468 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.78 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.67 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  27.51 
 
 		 466 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.38 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.86 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  52.94 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.48 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.09 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.7 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.7 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.09 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.09 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.81 
 
 		 457 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  25.59 
 
 		 454 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  29.51 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30.81 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.09 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 466 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  24.38 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  24.59 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  29.66 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.59 
 
 		 447 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.25 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30.45 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.37 
 
 		 429 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  32.11 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 224 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.97 
 
 		 228 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  25.88 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.97 
 
 		 228 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.23 
 
 		 212 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.97 
 
 		 228 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.75 
 
 		 230 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 209 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  24.25 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.23 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  29.31 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.04 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.22 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.75 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.45 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.03 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  27.59 
 
 		 355 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 210 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 215 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  26.06 
 
 		 459 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>