More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06262 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  689    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  84.49 
 
 
330 aa  531  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  58.79 
 
 
326 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  60.49 
 
 
321 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40.67 
 
 
318 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.79 
 
 
321 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.12 
 
 
320 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.48 
 
 
367 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.25 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
356 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  31.85 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  30.97 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  33.22 
 
 
331 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  30.35 
 
 
357 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  30.35 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  30.35 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  29.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  29.04 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  29.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  29.09 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  29.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  29.41 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  30.11 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  29.19 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  29.75 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  27.73 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  29.06 
 
 
369 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  31.46 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  28.73 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  28.45 
 
 
358 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.3 
 
 
365 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  28.49 
 
 
369 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.9 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  25.33 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  44.37 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.4 
 
 
367 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  26.92 
 
 
361 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 
222 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  46.67 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  46.67 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.29 
 
 
366 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  25 
 
 
368 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  49.02 
 
 
226 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 
224 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  26.02 
 
 
354 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  49.54 
 
 
217 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  28.22 
 
 
355 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
264 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  50.52 
 
 
459 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  49.54 
 
 
217 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  50.49 
 
 
230 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 
230 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  27.16 
 
 
341 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 
230 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  25.89 
 
 
372 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 
239 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.61 
 
 
372 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  47.42 
 
 
533 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.85 
 
 
240 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.86 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  25.27 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
228 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  45.37 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  47.42 
 
 
533 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  48.04 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  46.08 
 
 
217 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  43.4 
 
 
220 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  49.48 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  44.76 
 
 
237 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  44.35 
 
 
210 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  44.35 
 
 
210 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  26.93 
 
 
345 aa  96.3  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  49.04 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.86 
 
 
464 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  26.1 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 
262 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  42.48 
 
 
229 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  49.5 
 
 
415 aa  95.9  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.67 
 
 
220 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
224 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
237 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  48.51 
 
 
398 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.12 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>