More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4416 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  97.35 
 
 		 247 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  96.9 
 
 		 240 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  97.31 
 
 		 236 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  81.86 
 
 		 237 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  85.22 
 
 		 229 aa  331  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  83.48 
 
 		 229 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  81.74 
 
 		 237 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  81.74 
 
 		 237 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  71.82 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  74.88 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  56.19 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  53.15 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  46.4 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  46.4 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  48.21 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  47 
 
 		 219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  47.77 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  47 
 
 		 219 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  49.11 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  44.05 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  42.36 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  46.22 
 
 		 220 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  47.11 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  54.93 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  44.7 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  54.93 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  44.7 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  44.7 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  44.7 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  47.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.75 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.96 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  54.29 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  47 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.3 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  46.86 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  41.89 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.56 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  40.09 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.51 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  41.78 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.47 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.62 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  50.35 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  49.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  50.36 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  46.85 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  45.86 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  38.29 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.86 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.8 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  48.55 
 
 		 209 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  47.95 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.83 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  47.83 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  41.72 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.95 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.74 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  45.12 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  43.84 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  50 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  49.3 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  48.59 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  48.59 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  48.59 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>