More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0280 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  430  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  55.96 
 
 
222 aa  215  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  55.45 
 
 
223 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  57.99 
 
 
222 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  58.41 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  49.26 
 
 
225 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  45.83 
 
 
215 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 
231 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  48.13 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  44.74 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  48.73 
 
 
224 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.6 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.93 
 
 
215 aa  134  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.24 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.54 
 
 
236 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  45.77 
 
 
223 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  43.24 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  43.24 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  42.08 
 
 
237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
230 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
230 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
230 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
230 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.4 
 
 
243 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.4 
 
 
220 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  45.57 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  44.85 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  43.69 
 
 
221 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  45.77 
 
 
225 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  43.95 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  47.2 
 
 
224 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  43.69 
 
 
219 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  46.38 
 
 
217 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.3 
 
 
224 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
230 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  45.74 
 
 
220 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.27 
 
 
218 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  41.08 
 
 
205 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.27 
 
 
222 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.25 
 
 
217 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 
227 aa  122  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.2 
 
 
226 aa  121  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 
228 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.38 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  44.12 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  44.12 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  41.26 
 
 
225 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  44.25 
 
 
228 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  44.25 
 
 
228 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  45.39 
 
 
229 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  43.38 
 
 
229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  44.12 
 
 
229 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  44.68 
 
 
229 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.33 
 
 
223 aa  117  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.91 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.91 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  46.19 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.91 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  39.64 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.91 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  45.32 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.16 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.74 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.07 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  46.33 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 
236 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  46.19 
 
 
230 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.01 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.74 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  43.26 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  45.97 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  40.55 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  42.45 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  42.45 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  42.45 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 
229 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
228 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  48.7 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  42.28 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.26 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>