More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4257 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  60.1 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  50.48 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  46.24 
 
 		 241 aa  167  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  43.78 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  48.39 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.37 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  54.61 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  49.29 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  44.13 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  49.65 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  49.65 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  50.34 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  49.65 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  49.65 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  47.83 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  47.89 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.53 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.28 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  45.9 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.16 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  47.13 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42.08 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  40 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  43.72 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  48.59 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  43.72 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.44 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  47.18 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  50 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  48.28 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  43.58 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.38 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.91 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.12 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 		 240 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.66 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  46.38 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  46.38 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  45.65 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  45.65 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  45.65 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  47.14 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  46.04 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.03 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  43.48 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  48.92 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  46.81 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  45.77 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  42.75 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.29 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  43.36 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  37.98 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  40.72 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  43.15 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.66 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.65 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.64 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  33.95 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>