More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2087 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  96.31 
 
 
217 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  62.67 
 
 
218 aa  228  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  45.24 
 
 
225 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.91 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  52 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  46.01 
 
 
222 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  41.26 
 
 
222 aa  147  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.33 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 
218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 
218 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 
236 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.4 
 
 
231 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 
215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  43.84 
 
 
220 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  41.8 
 
 
241 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.91 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
221 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  40.09 
 
 
225 aa  131  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.22 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  45.14 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  36.7 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.68 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  41.46 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.28 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.28 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  39.7 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.28 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.6 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.28 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.38 
 
 
228 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 
222 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
219 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  42.27 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
221 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  42.27 
 
 
221 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 
219 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
241 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  44.93 
 
 
241 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.3 
 
 
294 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  47.79 
 
 
222 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
230 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.56 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  39.91 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.59 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45.59 
 
 
237 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  44.78 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  44.78 
 
 
316 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  43.66 
 
 
237 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  41.72 
 
 
244 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  37.62 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  44.85 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  44.85 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  44.85 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  44.03 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.73 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  39.88 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  37.44 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.07 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  40.97 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.64 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.86 
 
 
209 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.14 
 
 
217 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
215 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.93 
 
 
248 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.14 
 
 
217 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.28 
 
 
220 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  38.99 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.1 
 
 
224 aa  111  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.61 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>