More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1671 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  72.05 
 
 
229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  75.33 
 
 
229 aa  298  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  72.93 
 
 
229 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  63.88 
 
 
233 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  69.43 
 
 
229 aa  275  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  70.31 
 
 
229 aa  241  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  51.55 
 
 
236 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 
209 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 
230 aa  161  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  50.62 
 
 
224 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  50.75 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.55 
 
 
218 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  40.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  47.35 
 
 
225 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  42.35 
 
 
215 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.08 
 
 
215 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  47.19 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.98 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  42.77 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  43.62 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
231 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.97 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 
222 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
228 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  41 
 
 
225 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  48.55 
 
 
216 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.24 
 
 
228 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 
228 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.66 
 
 
241 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.01 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.56 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.94 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.76 
 
 
224 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 
227 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 
206 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  45.99 
 
 
236 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.63 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  43.67 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  37.74 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.3 
 
 
248 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.29 
 
 
226 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  39.9 
 
 
222 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  42.71 
 
 
225 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  45.76 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.2 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  45.67 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  47.46 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  42.49 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  45.76 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.63 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.71 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  51.35 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  42 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.2 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  44.92 
 
 
345 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 
218 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  36.49 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  46.38 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  46.61 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  42.14 
 
 
220 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.14 
 
 
243 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.13 
 
 
429 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  44.92 
 
 
344 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.87 
 
 
223 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  44.36 
 
 
222 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.55 
 
 
217 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.07 
 
 
344 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 
175 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  38.54 
 
 
225 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.26 
 
 
218 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 
222 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.92 
 
 
350 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.92 
 
 
350 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 
221 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
230 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 
221 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  46.49 
 
 
327 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
230 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
296 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 
224 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 
221 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
230 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.11 
 
 
237 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
230 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  42.41 
 
 
224 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
360 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  46.23 
 
 
331 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45.11 
 
 
237 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  40.29 
 
 
221 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.74 
 
 
447 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  42.96 
 
 
219 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.88 
 
 
230 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.64 
 
 
694 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  42.14 
 
 
238 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 
224 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>