More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0509 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  62.39 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  45.41 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  51.15 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.73 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  47.44 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  42.56 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  47.18 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  45.62 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  45.02 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  37.44 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  46.11 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  43.89 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  43.89 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  47.52 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.79 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  43.87 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  47.95 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.33 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  44.17 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.55 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  44.6 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  43.17 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  44.06 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.26 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.45 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  39.45 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  33.18 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  52.78 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  41.1 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  45.77 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  34.98 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  42.08 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  50 
 
 		 344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.43 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  43.97 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  50 
 
 		 344 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50 
 
 		 344 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.39 
 
 		 429 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  39.45 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  38.57 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  43.03 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  44.37 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  41.43 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.07 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  43.97 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  50.46 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.1 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.3 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.3 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  45.45 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.38 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  39.29 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  49.54 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  49.54 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.07 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  41.26 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.22 
 
 		 327 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  42.86 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.26 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  46.3 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.28 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.56 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  51.35 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  45.45 
 
 		 351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>