More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0163 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  51.15 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  47.79 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  43.32 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  45.36 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  44.86 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.58 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  46.33 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  42.2 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  49.64 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  44.5 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  40.89 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  42.33 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  48.94 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  56.03 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  47.53 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.11 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  49.64 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  48.2 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  48.2 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.21 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 236 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.65 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  43.89 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  47.52 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  42.34 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  49.28 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.36 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.14 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  46.1 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  46.1 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  44.17 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.33 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  44.94 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.55 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 182 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  56.19 
 
 		 344 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  56.19 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  46.1 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  56.19 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  43.98 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  53.21 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.67 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.25 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  41.43 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  46.48 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  54.29 
 
 		 345 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  45.32 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  53.15 
 
 		 327 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  54.29 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  54.29 
 
 		 344 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  44.59 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.04 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.04 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.31 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  54.05 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.3 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.3 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  54.29 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  46 
 
 		 286 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  54.29 
 
 		 350 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  54.29 
 
 		 350 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  41.94 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.57 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.45 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  43.88 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  43.26 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40.54 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  43.88 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  38.25 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.19 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  49.52 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>